Présentation

En plus des éléments régulateurs du promoteur viral 5’LTR, la transcription du VIH-1 est aussi contrôlée par une région cis-régulatrice intragénique (IRR) agissant comme un enhancer sur le 5’LTR. En utilisant la Micro-Capture-C (MCC), nous avons récemment démontré un contact chromatinien entre l’IRR et le 5’LTR dans le génome du VIH-1. Dans ce projet, nous validerons cette interaction par MCC, in vitro, dans des modèles d’infection de cellules T CD4+ et de macrophages primaires, puis ex vivo dans des cellules isolées d’individus VIH-1+. Nous étudierons ensuite le rôle des facteurs structuraux YY1 et CTCF dans la formation de ce contact, via des approches de knockdown et de mutagenèse dirigée. L’expression du VIH-1, l’accessibilité chromatinienne et le contact IRR-5’LTR seront évalués par ChIP/RT-qPCR, ATAC-seq et MCC. Ensemble, cette étude améliorera notre compréhension de la régulation génique du VIH-1 et pourrait révéler de nouvelles cibles thérapeutiques.

Promoteurs

  • Carine Van Lint, Service de virologie moléculaire, Département de Biologie moléculaire (DBM), ULB
  • James Davies, MRC Weatherall Institute of Molecular Medicine, Université d’Oxford